三黑暗聖域
三黑暗聖域是位於教堂的3個暗世界，同時是第四章的主要劇情發生地。名為 DELTA RUNE 的傳說在黑暗聖域中佔據了很大的位置，這些預言以漂浮玻璃窗格形式散布在三黑暗聖域中。
騎士創造了兩個黑暗噴泉：在教堂的大廳里有一個較小的噴泉，在主大廳里有一個較大的黑暗噴泉。這兩個噴泉分別創造了黑暗聖域和第三聖域，它們共享兩個黑暗噴泉的黑暗，這兩個聖所均屬於三黑暗聖域。
黑暗聖域，亦稱作第一聖所，是 Kris 和 Susie 在教堂內進入的第一個暗世界，而 Ralsei 也在他們跌落並撞碎了一塊預言玻璃後趕來。在中庭，騎士阻止小隊封印小噴泉，並把 Kris 和 Susie 腳下的階梯拆掉了，小隊掉落到了更低的地方。在探索黑暗聖域時，小隊遇到了 Gerson Boom ，他在遊戲中被小隊和旁白稱為"老人家"。他是小隊的指導者，尤其是 Susie 的指引者。在解決了各種謎題後，小隊再次在一個向左上的長階梯上遇到了騎士。 Susie 在樓梯上奔跑，試圖追趕騎士，但是騎士先一步離開，鎖上了大門 (該門與第一章中連通城堡鎮和平原，第三章結尾離開 TV 世界（或稱 Kris 的家) 的門相同)。
回到光世界後， Kris 和 Susie 嘗試去找主大廳的密碼時發現了老人家在光世界中對應的物體——放在 Alvin 神父辦公室柜子里的，封裝於玻璃罩中的怪物死後的塵埃，一把小錘子，和 Gerson Boom 的遺照。 過後不久 Susie 創建了第二聖域，在第二聖域中， Kris 和 Susie 看到了原來黑暗聖域中，老人家的書房的一個雕像 (正義之聲，在戰鬥中被旁白稱作"？？？")，誤以為是老人家 ，便追隨正義之聲。第二聖域的最後，一個滅火器告訴了小隊主大廳的門的密碼：2202。
騎士逃到了第三聖域，即本章的最後一個暗世界。小隊最終遇到了騎士， Susie 嘲諷了騎士，騎士卻不以為然並大笑。隨後騎士在第三聖域內創建了一個黑暗噴泉。新的黑暗噴泉從地下噴發，一會就凝結成了石頭，泰坦從中孵化。
在黑暗聖域中存在三個子區域。與前三章(紙牌王國、賽博世界、TV 世界)不同，這三個子區域並非同一暗世界的不同分區，而是三個獨立 (儘管它們相似) 的暗世界，各自擁有自己的噴泉。
黑暗聖域是"三黑暗聖域"中的首個暗世界。它由教堂大廳、儲物間以及 Alvin 神父的辦公室轉化而成，是三個聖所中規模最大的一個，內部包含多個子區域。同時，這裏也是唯一完整保留了老人家的書房的書房功能的暗世界。
這座暗世界是一座哥德式大教堂，它有錯綜複雜的華麗建築結構、高聳入雲的書架群、懸浮的玻璃掛毯群，其上銘刻著預言內容、遍布各處的暗之民石像，這些石像被現存的暗之民尊為祖先。
當光世界中第三聖域的大門開啟時，從教堂主大廳溢出的黑暗將會蔓延至教堂大廳，重塑最初的黑暗聖域並將其納入第三聖域，以及使所有第一、第二聖域的石像復甦 (這是最關鍵的變化)
第二聖域是三黑暗聖域中的第二個暗世界。它由 Susie 為復活 Gerson Boom 的暗之民形態(老人家)以向其詢問教堂主大廳的鎖的密碼而創造。
因為創造者是 Susie 而非騎士，所以這個暗世界是黑暗聖域的扭曲版本，建築結構呈現重複性幾何形態，整體呈現抽象化外觀，採用與其他兩個聖所完全不同的色調，有純黑色非解謎房間，復現了黑暗聖域的多個場景，但是所有場景都發生了某種程度的扭曲變形，暗之民狀態逆轉：原黑暗聖域的活躍暗之民全部石化變成爺爺，而原本的石像"祖先"暗之民則全部復甦。
第三聖域主要教堂主大廳轉化而成，是黑暗聖域的第三個暗世界。它完整保留了第二聖域的扭曲建築結構，同時融入了第一黑暗聖域的原始房間布局：整個空間布滿記載預言的玻璃掛毯。最重要的是，所有前兩個聖所的暗之民及暗之民石像均以活性形態存在，黑暗聖域和第二聖域的暗之民 在此共存。若透過特殊路徑返迴轉化後的黑暗聖域，可以看到由於第二聖域暗之民復甦，回溯時場景的變化。原先黑暗聖域中，老人家的書房裏去往大門並遭遇騎士的門會變為一個旋轉柱子攀爬謎題，玩家會操控 Kris 和煩人的狗進行攀爬比賽，途中煩人的狗的柱子會坍塌，但是煩人的狗會踩著高蹺追趕並超越 Kris (無論之前Kris爬的多塊)，最後煩人的狗一定會率先爬到頂端，但它徑直掠過寶箱，在拿到骨頭後離開了。箱子裏是狗幣，離開時會被傳送到書房左下角，並且進入攀爬比賽的們也會關上，再次調查的文本顯示"被某種神秘的犬科力量封印"。